化学工具锦囊

Chemdraw中24元环的快速画法

大环化合物近年来成为了药物化学研究的热点,其中环肽类结构是重要的组成部分。在绘制该类结构时,Chemdraw自身提供了相应的模板(如图1),可以绘制从6元环到20元环的结构。

图1 Chemdraw中提供的模板

 

但是当遇到大于20元环时就没有现成的模板可以使用,需要用户自己绘制了。比如在文献中遇到如图2中的这个环八肽结构的24元环,应该如何下手?

图2 文献中出现的24元环八肽结构

 

在此小编根据自己实践经验提供一种快速绘制24元环的方法。之所以选择24元环做示范,是与Chemdraw本身的一个设定有关。在Chemdraw中默认状态下可以随意旋转选定线段,但是当按住Alt键再对线段进行旋转时,操作将变为以15o为固定单位进行,这为24元环的快速绘制提供了可能(360o/24=15o)。

图3 基础操作得到3线段单元⑹

 

如图3所示,现在水平方向绘制一个单位线段,然后在右侧延长一个单位线段,在绘制过程中在十字星光标时即可拖动新绘制线段绕公共点进行顺时针旋转或者停止后选中最右端顶点在箭头光标下进行旋转,旋转时可以发现该操作是以最小固定角度进行的,即15o,(实操时候读者旋转6次可以发现后绘制线段与原线段垂直,证明旋转固定角度即15o),转过一个最小固定角度后停止得到,继续在旋转后的第